Dell AMD EPYC 7662 / NVIDIA Tesla A100
Softwares Instalados
| Yambo |
| Versão |
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| Descrição |
YAMBO implements Many-Body Perturbation Theory (MBPT) methods (such as GW and BSE) and Time-Dependent Density Functional Theory (TDDFT), which allows for accurate prediction of fundamental properties as band gaps of semiconductors, band alignments, defect quasi-particle energies, optics and out-of-equilibrium properties of materials.
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| Documentação |
Documentação do Yambo
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| Licença |
PUBLIC |
| Localização |
http://www.yambo-code.org/ |
Como usar
- Opções de módulos de ativação para uso:
VERSÕES ANTIGAS:
module load yambo/5.0.2-gcc-9.3.0 Recursos: GCC-9.3.0, OPENMPI-4.1.1, MKL, HDF5, NETCDF, LIBXC
module load yambo/5.0.2-gcc-9.4.0-mvapich2 Recursos: GCC-9.4.0, MVAPICH-2.3.6, MKL, HDF5, NETCDF, LIBXC
module load yambo/5.0.4-gcc-9.4.0-mvapich2 Recursos: GCC-9.4.0, MVAPICH-2.3.6, MKL, HDF5, NETCDF, LIBXC
module load yambo/5.0.4-gcc-9.4.0 Recursos: GCC-9.4.0, OPENMPI-4.1.1, MKL, HDF5, NETCDF, LIBXC
VERSÃO ATUAL:
module load yambo/gcc-openmpi Recursos: Versão 5.1.1, GCC-9.4.0, OPENMPI-4.1.1, MKL, HDF5, NETCDF, LIBXC, PETSc, SLEPc
- Características da instalação:
module help yambo/gcc-openmpi
Exemplo de script de submissão de um job:
#!/bin/bash
### Nome da fila de execução ###
#PBS -q par128
### Nome do job ###
#PBS -N teste
### Nome do arquivo de saida ###
#PBS -o saida
### Nome do arquivo de erros ###
#PBS -e erros
### Recursos necessarios para execução: ###
### nodes= Numero de nos computacionais ###
### ppn= Numero de processos por no ###
### Total de processos = nodes X ppn ###
#PBS -l nodes=1:ppn=128
cd $PBS_O_WORKDIR
echo "-----------------------------------------"
echo "Inicio do job:" `date`
### Configura ambiente para execução do Yambo ###
module load yambo/gcc-openmpi
export OMP_NUM_THREADS=2
### A opção -np indica o numero total de processos. ###
mpirun -np 64 yambo -F dados_entrada.in
echo "Final do job:" `date`
echo "-----------------------------------------"