Dell AMD EPYC 7662 / NVIDIA Tesla A100
Softwares Instalados
| VASP (Licenciado pelo usuário) |
| Versão |
6.4.3 6.4.2, 6.4.1, 6.3.2, 6.2.0, 6.1.1, 5.4.4.pl2, 5.4.4 |
| Descrição |
VASP is a complex package for performing ab-initio
quantum-mechanical molecular dynamic (MD) simulations using
pseudopotentials and a plane wave basis set.
|
| Documentação |
Documentação do VASP
|
| Licença |
Licenciado pelos usuários |
| Localização |
https://www.vasp.at/ |
Como usar
Roteiro para instalação do Vasp, apenas para as versões:6.4.3 6.4.2, 6.4.1, 6.3.2, 6.2.0, 6.2.1, 6.1.1, 5.4.4.pl2 e 5.4.4
- Licenciar e baixar os pacotes de uma das versões especificadas:
vasp.6.4.3.tgz
vasp.6.4.2.tgz
vasp.6.4.1.tgz
vasp.6.3.2.tgz
vasp.6.2.0.tgz
vasp.6.2.1.tgz
vasp.6.1.1.tgz
vasp.5.4.4.pl2.tgz
vasp.5.4.4.tgz
- Utilizar a instrução abaixo para instalar o Vasp.
source /opt/pub/scripts/instala_vasp.sh x.x.x
Exemplo da instalação do Vasp-5.4.4
source /opt/pub/scripts/instala_vasp.sh 5.4.4
- Será gerado um módulo de ativação para uso:
module load vasp/x.x.x-intel-2021.3.0
- Executáveis serão instalados na pasta:
$HOME/vasp/x.x.x/intel/2021.3.0/bin
- Executáveis que serão instalados:
vasp_gam
vasp_ncl
vasp_std
OBS:
x.x.x é a indicação de uma das versões Vasp.
Exemplo de script de submissão de um job:
#!/bin/bash
### Nome da fila de execucao ###
#PBS -q par16
### Nome do job ###
#PBS -N teste
### Nome do arquivo de saida ###
#PBS -o saida
### Nome do arquivo de erros ###
#PBS -e erro
### Recursos alocados para execucao:
#PBS -l nodes=1:ppn=16
cd $PBS_O_WORKDIR
echo "-----------------------------------------"
echo "Inicio do job:" `date`
### Configura o ambiente para executar o Vasp ###
module load vasp/5.4.4.pl2-intel-2021.3.0
### A opcao -np indica o numero de processos, um por GPU ###
mpirun -np 16 vasp_std
echo "Final do job:" `date`
echo "-----------------------------------------"