Dell AMD EPYC 7662 / NVIDIA Tesla A100
Softwares Instalados
| RASPA2 |
| Versão |
2.0.47 |
| Descrição |
A molecular-dynamics, monte-carlo and optimization code for nanoporous materials. This software is a general purpose classical simulation package. It has been developed at Northwestern University (Evanston, USA) during 2006-2011 in active collaboration with University Pablo de Olavide (Seville, Spain), and the Technical University of Delft. It can be used for the simulation of molecules in gases, fluids, zeolites, aluminosilicates, metal-organic frameworks, carbon nanotubes and external fields.
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| Documentação |
Documentação do RASPA2
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| Licença |
The MIT License - Free charge |
| Localização |
https://github.com/iraspa/RASPA2 |
Como usar
- Módulo de ativação para uso:
module load raspa2/2.0.47-gcc-9.4.0
- Executáveis disponíveis na pasta:
/opt/pub/raspa2/2.0.47/gcc/9.4.0/bin
simulate
OBS: Esse programa executável possui processamento apenas serial (Utiliza apenas os recursos de um core).
Exemplo de script de submissão de um job para a fila 'serial':
#!/bin/bash
### Nome da fila de execução ###
#PBS -q serial
### Nome do job ###
#PBS -N teste
### Nome do arquivo de saida ###
#PBS -o saida
### Nome do arquivo de erros ###
#PBS -e erros
cd $PBS_O_WORKDIR
echo "-----------------------------------------"
echo "Inicio do job:" `date`
### Configura ambiente para execução do RASPA2 ###
module load raspa2/2.0.47-gcc-9.4.0
export OMP_NUM_THREADS=1
simulate -i nome_arquivo_input
echo "Final do job:" `date`
echo "-----------------------------------------"