Dell AMD EPYC 7662 / NVIDIA Tesla A100

Softwares Instalados

Categoria: Química/Física

QMCPACK
Versão	3.16.0
Descrição	QMCPACK is an open-source, high-performance electronic structure code that implements numerous Quantum Monte Carlo algorithms. Its main applications are electronic structure calculations of molecular, periodic 2D and periodic 3D solid-state systems. Variational Monte Carlo (VMC), diffusion Monte Carlo (DMC) and a number of other advanced QMC algorithms are implemented. By directly solving the Schrodinger equation, QMC methods offer greater accuracy than methods such as density functional theory, but at a trade-off of much greater computational expense. Distinct from many other correlated many-body methods, QMC methods are readily applicable to both bulk (periodic) and isolated molecular.
Documentação	Documentação do QMCPACK QMCPACK Forum
Licença	Open Source
Localização	https://qmcpack.org/

Como usar

- Módulo de ativação para uso:

module load qmcpack/3.16.0-gcc-9.4.0

- Executáveis disponíveis na pasta:

/opt/pub/spack/qmcpack/3.16.0/gcc/9.4.0/bin

qmcpack
convert4qmc
convertpw4qmc
ppconvert
qmc-check-affinity
qmcfinitesize

OBS: Essa instalação do QMCPACK não utiliza recursos de processamento em GPUS.

Exemplo de script de submissão de um job MPI para a fila 'par128':

#!/bin/bash

### Nome da fila de execução ###
 #PBS -q par128

### Nome do job ###
 #PBS -N teste

### Nome do arquivo de saida ###
 #PBS -o saida

### Nome do arquivo de erros ###
 #PBS -e erros

### Recursos necessarios para execução:     ###
###   nodes=   Numero de nos computacionais ###
###   ppn=     Numero de processos por no   ###
### Total de processos = nodes X ppn        ###
 #PBS -l nodes=1:ppn=128

cd $PBS_O_WORKDIR

echo "-----------------------------------------"

echo "Inicio do job:" `date`

### Configura ambiente para execução do QMCPACK ###

module load qmcpack/3.16.0-gcc-9.4.0

export OMP_NUM_THREADS=1

ulimit -s unlimited

### A opção -np indica o numero total de processos.  ###

mpirun -np 128 qmcpack input_dados.xml

echo "Final do job:" `date`

echo "-----------------------------------------"

Exemplo de script de submissão de um job MPI+OPENMP para a fila 'par128':

#!/bin/bash

### Nome da fila de execução ###
 #PBS -q par128

### Nome do job ###
 #PBS -N teste

### Nome do arquivo de saida ###
 #PBS -o saida

### Nome do arquivo de erros ###
 #PBS -e erros

### Recursos necessarios para execução:     ###
###   nodes=   Numero de nos computacionais ###
###   ppn=     Numero de processos por no   ###
### Total de processos = nodes X ppn        ###
 #PBS -l nodes=1:ppn=128

cd $PBS_O_WORKDIR

echo "-----------------------------------------"

echo "Inicio do job:" `date`

### Configura ambiente para execução do QMCPACK ###

module load qmcpack/3.16.0-gcc-9.4.0

export OMP_NUM_THREADS=2

ulimit -s unlimited

### A opção -np indica o numero total de processos.  ###

mpirun -np 64 qmcpack input_dados.xml

echo "Final do job:" `date`

echo "-----------------------------------------"