Dell AMD EPYC 7662 / NVIDIA Tesla A100

Softwares Instalados

Categoria: Bibliotecas

HDF5
Versão
Descrição	The HDF Group is the developer of HDF5®, a high-performance software library and data format that has been adopted across multiple industries and is the de facto standard in the scientific and research community.
Documentação	Documentação
Licença	Free
Localização	https://www.hdfgroup.org/solutions/hdf5/

Como usar

Existem atualmente, quatro versões da biblioteca HDF5 em oito instalações diferentes:

- Opções de módulos de ativação para uso:

module load hdf5/1.10.7-gcc-9.4.0 Compilada com gcc-9.4.0 e biblioteca OpenMPI-4.1.1
module load hdf5/1.10.7-intel-2022.0.1 Compilada com Intel-OneAPI-2022.0.1
module load hdf5/1.10.7-intel-2021.3.0 Compilada com Intel-OneAPI-2021.3.0
module load hdf5/1.10.8 Compilada com gcc-9.4.0, serial
module load hdf5/1.12.1-mvapich2 Compilada com gcc-9.4.0 e biblioteca MVAPICH2-2.3.6
module load hdf5/1.12.2-intel-2023.2.1 Compilada com Intel-OneAPI-2023.2.1
module load hdf5/1.14.0-intel-2021.3.0 Compilada com Intel-OneAPI-2021.3.0
module load hdf5/1.14.0-gcc-12.2.0 Compilada com gcc-12.2.0
module load hdf5/1.14.6-gcc-15.2.0 Compilada com gcc-15.2.0

A utilização da biblioteca HDF5 é feita nos processos de compilação e
linkedição de softwares. É possível ao usuário instalar a versão da HDF5
que for necessária para os seus programas, na sua conta. A instalação pode ser feita com auxílio do instalador 'spack'. Exemplo de instalação:

1-Verificar as versões disponíveis do software HDF5 para instalação

spack info hdf5

2-Verificar a lista de compiladores disponíveis

spack compiler list

3-Instalar a versão hdf5-1.12.1 com gcc-9.4.0 e OpenMPI-4.1.1

spack install hdf5@1.12.1 %gcc@9.4.0 ^openmpi@4.1.1

4-A versão do HDF5 será instalada na pasta:

$HOME/hdf5/1.12.1/gcc/9.4.0

5-Será criado um módulo de configuração na pasta:

$HOME/modulefiles/hdf5/1.12.1-gcc-9.4.0