Dell AMD EPYC 7662 / NVIDIA Tesla A100

Softwares Instalados

Categoria: Química/Física

CPMD
Versão	4.3
Descrição	CPMD is a parallelized plane-wave DFT code designed for ab-initio molecular dynamics
Documentação	CPMD Manual
Licença	MIT License (Free of charge)
Localização	https://github.com/CPMD-code

Como usar

- Opções de módulos de ativação para uso:

CPMD 4.3

module load cpmd/4.3-intel-2021.3.0

     Compilador: Intel OneAPI 2021.3.0
    Executáveis: /opt/pub/spack/cpmd/4.3/intel/2021.3.0/bin
       Recursos: Intel MPI, OpenMP, Intel MKL

Exemplo de script de submissão de um job para a fila 'par128':

#!/bin/bash
### Nome da fila de execucao ###
#PBS -q par128

### Nome do job ###
#PBS -N teste

### Nome do arquivo de saida ###
#PBS -o saida

### Nome do arquivo de erros ###
#PBS -e erro

### Recursos necessarios para execucao:     ###
###   nodes=   Numero de nos computacionais ###
###   ppn=     Numero de processos por no   ###
### Total de processos = nodes X ppn        ###
#PBS -l nodes=1:ppn=128

cd $PBS_O_WORKDIR
echo "-----------------------------------------"
echo "Inicio do job:" `date`

### Configura ambiente para execucao do CPMD ###

module load cpmd/4.3-intel-2021.3.0

export OMP_NUM_THREADS=2

### Os arquivos de "input" e PseudoPotential necessariamente devem  ###
### estar localizados na pasta de onde foi submetido o job          ###

mpirun -np 64 cpmd.x arquivo_input.in > resultados.out

echo "Final do job:" `date`
echo "-----------------------------------------"