Dell AMD EPYC 7662 / NVIDIA Tesla A100
Softwares Instalados
| ABINIT |
| Versão |
9.8.2 |
| Descrição |
ABINIT is a package whose main program allows one to find the total energy, charge density and electronic structure of systems made of electrons and nuclei (molecules and periodic solids) within Density Functional Theory (DFT), using pseudopotentials and a planewave or wavelet basis. ABINIT also includes options to optimize the geometry according to the DFT forces and stresses, or to perform molecular dynamics simulations using these forces, or to generate dynamical matrices, Born effective charges, and dielectric tensors, based on Density-Functional Perturbation Theory, and many more properties. Excited states can be computed within the Many-Body Perturbation Theory (the GW approximation and the Bethe-Salpeter equation), and Time-Dependent Density Functional Theory (for molecules). In addition to the main ABINIT code, different utility programs are provided.
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| Documentação |
Documentação do ABINIT
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| Licença |
GNU GENERAL PUBLIC LICENSE |
| Localização |
http://www.abinit.org/ |
Como usar
- Opções de módulos de ativação para uso:
module load abinit/9.8.2-intel-2022.0.1 Intel-OneAPI-2022.0.1
- Recursos instalados:
FFTW
HDF5
LIBXC
LIBXML2
MKL
NETCDF
PFFT
WANNIER90
XMLF90
Exemplo de script para execução em filas de processamento com o PBS:
#!/bin/bash
### Nome da fila de execução ###
#PBS -q par128
### Nome do job ###
#PBS -N teste
### Nome do arquivo de saida ###
#PBS -o OUTPUT
### Nome do arquivo de erros ###
#PBS -e ERRO
### Recursos necessarios para execução: ###
### nodes= Numero de nos computacionais ###
### ppn= Numero de processos por no ###
### Total de processos = nodes X ppn ###
#PBS -l nodes=1:ppn=128
cd $PBS_O_WORKDIR
echo "-----------------------------------------"
echo "Inicio do job:" `date`
### Configura o ambiente para execução do Abinit ###
module load abinit/9.8.2-intel-2022.0.1
export OMP_NUM_THREADS=1
### A opção -n indica o numero total de processos. ###
mpirun -np 128 abinit run.abi > saida
echo "Final do job:" `date`
echo "-----------------------------------------"
Submissão do script: