Dell AMD EPYC 7662 / NVIDIA Tesla A100

Softwares Instalados

Categoria: Matemática

R 4.1.2
Versão	4.1.2
Descrição	Linguagem para computação estatística e gráfica.
Documentação	Manual Package parallel
Licença	Public
Localização	http://cran.r-project.org/

Como usar

- Módulo de ativação para uso:

module load R/4.1.2     Compilada com gcc-9.4.0

- Verificar os pacotes instalados atualmente:

ls /opt/ohpc/pub/libs/gnu9/R/4.1.2/lib64/R/library

OBS: Se for necessário a instalação de um novo pacote, solicite a equipe de Suporte Técnico do
CENAPAD-SP

Exemplo de script de submissão de um job:

#!/bin/bash
### Nome da fila de execucao ###
#PBS -q par128

### Nome do job ### 
#PBS -N teste 

### Nome do arquivo de saida ###
#PBS -o saida

### Nome do arquivo de erros ###
#PBS -e erro

### Recursos necessarios para execucao:     ###
###   nodes=   Numero de nos computacionais ###
###   ppn=     Numero de processos por no   ###
### Total de processos = nodes X ppn        ###
#PBS -l nodes=1:ppn=128 

cd $PBS_O_WORKDIR
echo "-----------------------------------------"
echo "Inicio do job:" `date`

### Configura o ambiente para executar o R ### 

export OMP_NUM_THREADS=128
module load R/4.1.2

### Execucao paralela multithread do R ###

R --no-save CMD BATCH INPUT.R

echo "Final do job:" `date`
echo "-----------------------------------------"