Dell AMD EPYC 7662 / NVIDIA Tesla A100
Softwares Instalados
| Octopus |
| Versão |
12 |
| Descrição |
Octopus is a pseudopotential real-space package aimed at the simulation of the electron-ion dynamics of one-, two-, and three-dimensional finite systems subject to time-dependent electromagnetic fields. The program is based on time-dependent density-functional theory (TDDFT) in the Kohn-Sham scheme. All quantities are expanded in a regular mesh in real space, and the simulations are performed in real time. The program has been successfully used to calculate linear and non-linear absorption spectra, harmonic spectra, laser induced fragmentation, etc. of a variety of systems.
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| Documentação |
Manual do Octopus
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| Licença |
PUBLIC |
| Localização |
https://www.octopus-code.org/documentation/main/ |
Como usar
- Módulo de ativação para uso:
module load octopus/12-intel-2022.0.1
Compilador: Intel-2022.0.1
Bibliotecas: Intel MPI-2021.5.0, MKL-2022.0.1
Exemplo de script para execução em filas de processamento com o PBS:
### Nome da fila de execução ###
#PBS -q par128
### Nome do job ###
#PBS -N teste
### Nome do arquivo de saida ###
#PBS -o OUTPUT
### Nome do arquivo de erros ###
#PBS -e ERRO
### Recursos necessarios para execução: ###
### nodes= Numero de nos computacionais ###
### ppn= Numero de processos por no ###
### Total de processos = nodes X ppn ###
#PBS -l nodes=1:ppn=128
cd $PBS_O_WORKDIR
echo "-----------------------------------------"
echo "Inicio do job:" `date`
module load octopus/12-intel-2022.0.1
export OMP_NUM_THREADS=2
### Execução do Octopus ###
mpirun -np 64 octopus
echo "Final do job:" `date`
echo "-----------------------------------------"