Dell AMD EPYC 7662 / NVIDIA Tesla A100

Softwares Instalados

Categoria: Química/Física

NWChem
Versão 7.0.2, 7.3.1
Descrição The NWChem software contains computational chemistry tools that are scalable both in their ability to efficiently treat large scientific problems. NWChem can handle: Biomolecules, nanostructures, and solid-state; From quantum to classical, and all combinations; Ground and excited-states; Gaussian basis functions or plane-waves; Scaling from one to thousands of processors; Properties and relativistic effects
Documentação NWChem User Documentation
Licença Open-source under the terms of the Educational Community License version 2.0
Localização https://www.nwchem-sw.org/

Como usar

- Opções de módulos de ativação para uso:
NWChem 7.3.1
module load nwchem/7.3.1-intel-2023.2.1

     Compilador: Intel OneAPI-2023.2.1
    Executáveis: /opt/pub/nwchem/7.3.1/intel/2023.2.1/bin
       Recursos: Intel MPI, Intel MKL, OpenMP, CUDA
NWChem 7.0.2
module load nwchem/7.0.2-intel-2019.5.0

     Compilador: Intel Parallel Studio 2019.5.0
    Executáveis: /opt/pub/nwchem/7.0.2/intel/2019.5.0/bin
       Recursos: Intel MPI, Intel MKL, OpenMP, CUDAi

Exemplo de script de submissão de um job:

#!/bin/bash

### Nome da fila de execução ###
 #PBS -q par128

### Nome do job ###
 #PBS -N teste

### Nome do arquivo de saida ###
 #PBS -o saida

### Nome do arquivo de erros ###
 #PBS -e erros

### Recursos necessarios para execução:     ###
###   nodes=   Numero de nos computacionais ###
###   ppn=     Numero de processos por no   ###
### Total de processos = nodes X ppn        ###
 #PBS -l nodes=1:ppn=128

cd $PBS_O_WORKDIR

echo "-----------------------------------------"

echo "Inicio do job:" `date`

### Configura ambiente para execução do NWChem ###

module load nwchem/7.3.1-intel-2023.2.1

export OMP_NUM_THREADS=1

ulimit -s unlimited

### A opção -np indica o numero total de processos.  ###

mpirun -np 128 nwchem input.nw

echo "Final do job:" `date`

echo "-----------------------------------------"