Dell AMD EPYC 7662 / NVIDIA Tesla A100
Softwares Instalados
| NWChem 7.0.2 |
| Versão |
7.0.2 |
| Descrição |
The NWChem software contains computational chemistry tools that are scalable both in their ability to efficiently treat large scientific problems. NWChem can handle: Biomolecules, nanostructures, and solid-state; From quantum to classical, and all combinations; Ground and excited-states; Gaussian basis functions or plane-waves; Scaling from one to thousands of processors; Properties and relativistic effects
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| Documentação |
NWChem User Documentation
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| Licença |
Open-source under the terms of the Educational Community License version 2.0 |
| Localização |
https://www.nwchem-sw.org/ |
Como usar
- Configuração inicial necessária:
ln -s /opt/pub/nwchem/7.0.2/intel/2019.5.0/data/default.nwchemrc $HOME/.nwchemrc
OBS: Esse comando deve ser executado pelo usuário, uma única vez, para permitir acesso aos
'Data files (basis sets, force fields, etc.)' do NWChem
- Módulos de ativação para uso:
module load nwchem/7.0.2-intel-2019.5.0
- Executável disponível na pasta: /opt/pub/nwchem/7.0.2/intel/2019.5.0/bin
nwchem Permite processamento paralelo multitask - MPI, multithread - OpenMP e vetorial - CUDA (GPUs)
Exemplo de script de submissão de um job:
#!/bin/bash
### Nome da fila de execução ###
#PBS -q par128
### Nome do job ###
#PBS -N teste
### Nome do arquivo de saida ###
#PBS -o saida
### Nome do arquivo de erros ###
#PBS -e erros
### Recursos necessarios para execução: ###
### nodes= Numero de nos computacionais ###
### ppn= Numero de processos por no ###
### Total de processos = nodes X ppn ###
#PBS -l nodes=1:ppn=128
cd $PBS_O_WORKDIR
echo "-----------------------------------------"
echo "Inicio do job:" `date`
### Configura ambiente para execução do NWChem ###
module load nwchem/7.0.2-intel-2019.5.0
export OMP_NUM_THREADS=1
ulimit -s unlimited
### A opção -np indica o numero total de processos. ###
mpirun -np 128 nwchem input.nw
echo "Final do job:" `date`
echo "-----------------------------------------"