Dell AMD EPYC 7662 / NVIDIA Tesla A100

Softwares Instalados

Categoria: Química/Física

GPAW 21.6.1b1
Versão	21.6.1b1
Descrição	GPAW is a density-functional theory (DFT) Python code based on the projector-augmented wave (PAW) method and the atomic simulation environment (ASE
Documentação	Documentacao
Licença	Open-Source License
Localização	https://wiki.fysik.dtu.dk/gpaw/

Como usar

- Módulo de ativação para uso:

module load gpaw/21.6.1b1-intel-2021.3.0

- Executáveis disponíveis com o python-3.8.11, na pasta: /opt/pub/spack/python/3.8.11/intel/2021.3.0/bin

gpaw
gpaw-basis
gpaw-runscript
gpaw-upfplot
gpaw-analyse-basis
gpaw-plot-parallel-timings
gpaw-setup

Exemplo de script de submissão de um job:

#!/bin/bash
### Nome da fila de execucao ###
#PBS -q par128

### Nome do job ###
#PBS -N teste

### Nome do arquivo de saida ###
#PBS -o saida

### Nome do arquivo de erros ###
#PBS -e erro

### Recursos necessarios para execucao:     ###
###   nodes=   Numero de nos computacionais ###
###   ppn=     Numero de processos por no   ###
### Total de processos = nodes X ppn        ###
#PBS -l nodes=1:ppn=128

cd $PBS_O_WORKDIR
echo "-----------------------------------------"
echo "Inicio do job:" `date`

module load gpaw/21.6.1b1-intel-2021.3.0

### A opcao -np indica o numero total de processos.    ###

mpirun -np 128 gpaw python script_python.py

echo "Final do job:" `date`
echo "-----------------------------------------"