Dell AMD EPYC 7662 / NVIDIA Tesla A100

Softwares Instalados

Categoria: Química/Física

Elk
Versão 8.3.22 e 7.2.42
Descrição An all-electron full-potential linearised augmented-plane wave (LAPW) code with many advanced features.
Documentação The Elk Code
Documentação
Licença GPL
Localização https://elk.sourceforge.io/

Como usar

- Módulos de ativação para uso:

module load elk/spack-intel-mkl Versão 8.3.22, Intel OneAPI-2022.0.1, Intel MPI, Intel MKL, LIBXC, WANNIER90
module load elk/7.2.42-gcc-9.4.0 Versão 7.2.42, GNU-9.4.0, OpenMPI, LIBXC

- Executáveis disponíveis na pasta:

/opt/pub/spack/elk/8.3.22/intel/2022.0.1/bin
/opt/pub/spack/elk/7.2.42/gcc/9.4.0/bin

elk
eos
spacegroup

Exemplo de script de submissão de um job para a fila 'par128':

#!/bin/bash
### Nome da fila de execucao ###
#PBS -q par128

### Nome do job ###
#PBS -N teste

### Nome do arquivo de saida ###
#PBS -o saida

### Nome do arquivo de erros ###
#PBS -e erro

### Recursos necessarios para execucao:     ###
###   nodes=   Numero de nos computacionais ###
###   ppn=     Numero de processos por no   ###
### Total de processos = nodes X ppn        ###
#PBS -l nodes=1:ppn=128

cd $PBS_O_WORKDIR
echo "-----------------------------------------"
echo "Inicio do job:" `date`

### Configura ambiente para execucao do elk ###

module load elk/spack-intel-mkl

export OMP_NUM_THREADS=2
export OMP_STACKSIZE=64M
export I_MPI_PIN=0

### Os arquivos de "input" necessariamente devem estar localizados  ###
### na pasta de onde foi submetido o job                            ###

mpirun -np 64 elk

echo "Final do job:" `date`
echo "-----------------------------------------"