Projetos Ativos
Publicações do projeto
| proj577 | Univ. Federal do Triangulo Mineiro | Departamento de Fisica |
|---|---|---|
| Simulacao Computacional de Proteinas. | ||
| Publicações | Mestrado | Doutorado |
| 31 | 2 | 1 |
| Publicação J. Chem. Phys. |
Data, Vol/Fasc/Pag 2025 Mar 21. |
| Título The synergy between compartmentalization and motorization in chromatin architecture. | |
| Autores Ronaldo J Oliveira, Antonio B Oliveira Jr, Vinicius G Contessoto, Jose N Onuchic. | |
| Publicação International Journal of Biological Macromolecules. |
Data, Vol/Fasc/Pag Volume 259, Part 2 , Feb 2024, 129192. |
| Título Interaction between diterpene icetexanes and old yellow enzymes of Leishmania braziliensis and Trypanosoma cruzi. | |
| Autores Silvia H. Libardi et al. | |
| Publicação ACS Chem. Biol. |
Data, Vol/Fasc/Pag 2024, 19, 3, 669-686. |
| Título Uncovering the Association Mechanism between Two Intrinsically Flexible Proteins. | |
| Autores Angy Liseth Davalos et al. | |
| Publicação J. Phys. Chem. B. |
Data, Vol/Fasc/Pag 2022, 126, 51, 10854-10869. |
| Título Coordinate-Dependent Drift-Diffusion Reveals the Kinetic Intermediate Traps of Top7-Based Proteins. | |
| Autores Ronaldo Junio de Oliveira. | |
| Publicação The Journal of Chemical Physics. |
Data, Vol/Fasc/Pag Volume 156, Issue 19 - 21 may 2022. |
| Título Biotin-painted proteins have thermodynamic stability switched by kinetic folding routes. | |
| Autores Frederico Campos Freitas et al. | |
| Publicação Polyhedron. |
Data, Vol/Fasc/Pag Volume 219, 1 June 2022, 115767. |
| Título Gold(III) heteroleptic complexes with SNS-thiosemicarbazonate ligands as cytotoxic agents: Experi. and comput. insights into the mechanism of action. | |
| Autores AmandhaKaiser da Silva, MaluMateus Santos, PamelaAparecida Candido, et al. | |
| Publicação The Journal of Chemical Physics. |
Data, Vol/Fasc/Pag 156, 195101 (2022). |
| Título Biotin-painted proteins have thermodynamic stability switched by kinetic folding routes. | |
| Autores Frederico Campos Freitas, Michelli Maldonado, et al. | |
| Publicação Bioorganic Chemistry. |
Data, Vol/Fasc/Pag Volume 120, March 2022, 105593. |
| Título Cholinesterase inhibitors assessment of aporphine alkaloids from Annona crassiflora and molecular docking studies. | |
| Autores Marilia Fontes Barbosa, Allisson Benatti Justino, et al. | |
| Publicação European Journal of Chemistry. |
Data, Vol/Fasc/Pag 2021, 12(3), 235-241. |
| Título Nitroisatin dithiocarbazate: Synthesis, structural characterization, DFT, and docking studies. | |
| Autores Pedro Henrique do Nascimento Pereira, Jackelinne Camargo Lima, et al. | |
| Publicação Talanta. |
Data, Vol/Fasc/Pag Volume 235, 1 December 2021, 122694. |
| Título Ninhydrin as a novel DNA hybridization indicator applied to a highly reusable electrochemical genosensor for Candida auris. | |
| Autores Pedro H.G.Guedes, Jessica G.Brussasco, et al. | |
| Publicação Biophysica. |
Data, Vol/Fasc/Pag 2021, 1(2), 204-221. |
| Título The Dynamics of Subunit Rotation in a Eukaryotic Ribosome. | |
| Autores Frederico Campos Freitas, Gabriele Fuchs, Ronaldo Junio de Oliveira e Paul Charles Whitford. | |
| Publicação Journal of Chemical Information and Modeling |
Data, Vol/Fasc/Pag 2021 v. 61, p. 1226-1243 |
| Título Shedding Light on the Inhibitory Mechanisms of SARS-CoV-1/CoV-2 Spike Proteins by ACE2-Designed Peptides | |
| Autores FREITAS, F.C. ; FERREIRA, P.H.G; FAVARO, D.C.; DE OLIVEIRA, R.J. | |
| Publicação Journal of Physical Chemistry Letters |
Data, Vol/Fasc/Pag 2020 v. 11, p. 800-807 |
| Título Extension-Dependent Drift Velocity and Diffusion(DrDiff)Directly Reconstructs the Folding Free Energy Landscape of Atomic Force Microscopy Experiments | |
| Autores FREITAS, F.C.; DE OLIVEIRA, R.J. | |
| Publicação Journal of Chemical Information and Modeling |
Data, Vol/Fasc/Pag 2020 v. 1, p. acs.jcim.9b00797-1 |
| Título The Role of Electrostatics and Folding Kinetics on the Thermostability of Homologous Cold Shock Proteins | |
| Autores FERREIRA, P.H.G et al. | |
| Publicação The Journal of Chemical Physics |
Data, Vol/Fasc/Pag v149 i23 Nov 2018 |
| Título Stochastic diffusion framework determines the free-energy landscape and rate from single-molecule trajectory | |
| Autores Ronaldo Junio de Oliveira | |
| Publicação Bioorganic and Medicinal Chemistry |
Data, Vol/Fasc/Pag V26, I22, 1 Dec 2018, pp 5816-5823 |
| Título Isolation, leishmanicidal evaluation and molecular docking simulations of piperidine alkaloids from Senna spectabilis | |
| Autores Rosimeire Borges Moreira Lacerda et al. | |
| Publicação Nov Appro Drug Des Dev |
Data, Vol/Fasc/Pag v.5, p.555651 - 555653, 2019 |
| Título Theoretical Approaches for Treatment of Neglected Tropical Diseases by Drug Designed Gold Complexes with Thiosemicarbazone. | |
| Autores OLIVEIRA, Ronaldo Júnio de | |
| Publicação ACS Infectious Diseases |
Data, Vol/Fasc/Pag 2019 v5 i10 pp1698-1707 |
| Título Organometallic Gold(III) Complex [Au(Hdamp)(L14)]+ (L1 = SNS-Donating Thiosemicarbazone) as a Candidate to New Formulations against Chagas Disease | |
| Autores Carla Duque Lopes et al. | |
| Publicação Biomedicine and Pharmacotherapy |
Data, Vol/Fasc/Pag v.109, p.157 - 166, 2019. |
| Título In vitro anti-Trypanosoma cruzi activity of ternary copper(II) complexes and in vivo evaluation of the most promising complex | |
| Autores Drielly A.Paixão, Carla D.Lopes, Zumira A.Carneiro et al. | |
| Publicação Biochemistry |
Data, Vol/Fasc/Pag 2019 v58 i34 pp3604-3616 |
| Título Importance of the β5−β6 Loop for the Structure, Catalytic Efficiency, and Stability of Carbapenem-Hydrolyzing Class D β-Lactamase | |
| Autores OXA-143 | |
| Publicação Journal of Chemistry |
Data, Vol/Fasc/Pag 2019, Article ID 3410953 |
| Título Identification of Bioactive Compounds and Analysis of Inhibitory Potential of the Digestive Enzymes from Syzygium sp. Extracts | |
| Autores Freitas et al. | |
| Publicação European Journal of Medicinal Chemistry |
Data, Vol/Fasc/Pag v180, 15 October 2019, pp213-223 |
| Título Heterobimetallic nickel(II) and palladium(II) complexes derived from S-benzyl-N- (ferrocenyl)methylenedithiocarbazate:Trypanocidal activity and ... | |
| Autores Carneiro et al. | |
| Publicação The Journal of Chemical Physics |
Data, Vol/Fasc/Pag 151, 114106 (2019) |
| Título Drift-diffusion (DrDiff) framework determines kinetics and thermodynamics of two-state folding trajectory and tunes diffusion models | |
| Autores Freitas Frederico; LIMA, Angelica Nakagawa; GODOI, Contessoto Vinícius ; WHITFORD, Paul C.; OLIVEIRA | |
| Publicação Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis |
Data, Vol/Fasc/Pag v175, 25 October 2019, 112778 |
| Título A novel peptide-based sensor platform for detection of anti-Toxoplasma gondii immunoglobulins | |
| Autores Lívia; S., Barros Heber L.; R., Flauzino José M.; G., Guedes Pedro H et al. | |
| Publicação Biophysical Journal |
Data, Vol/Fasc/Pag V116, Issue 4, 19 Feb 2019, pp621-632 |
| Título A Dynamic Hydrophobic Core and Surface Salt Bridges Thermostabilize a Designed Three-Helix Bundle | |
| Autores Nguyen; T., Young Jennifer; G., Slade Gabriel; OLIVEIRA, Ronaldo Júnio de; E., Mccully Michelle | |
| Publicação Bioorganic & Medicinal Chemistry. |
Data, Vol/Fasc/Pag Available online 2 November 2018. |
| Título Isolation, leishmanicidal evaluation and molecular docking simulations of piperidine alkaloids from Senna spectabilis. | |
| Autores Rosimeire Borges Moreira Lacerda, et al. | |
| Publicação Biomedicine & Pharmacotherapy. |
Data, Vol/Fasc/Pag Volume 109, January 2019, Pages 157-166. |
| Título In vitro anti-Trypanosoma cruzi activity of ternary copper(II) complexes and in vivo evaluation of the most promising complex. | |
| Autores Drielly A. Paixao, et al. | |
| Publicação Revista Brasileira de Ensino de Fisica. |
Data, Vol/Fasc/Pag vol.40 no.4 Sao Paulo 2018. |
| Título Introducao ao problema de enovelamento de proteinas: uma abordagem utilizando modelos computacionais simplificados. | |
| Autores Vinicius de Godoi Contessoto et al. | |
| Publicação Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. |
Data, Vol/Fasc/Pag Available online 10 November 2017. |
| Título Supersymmetric quantum mechanics method for the Fokker-Planck equation with applications to protein folding dynamics. | |
| Autores Franciele Polotto, Elso Drigo Filho, Jorge Chahine, Ronaldo Junio de Oliveira. | |
| Publicação European Journal of Medicinal Chemistry. |
Data, Vol/Fasc/Pag Vol.141, 1-12-2017, Pages 615-631. |
| Título PtII, PdII and AuIII complexes with a thiosemicarbazone derived from diacethylmonooxime: Structural analysis, trypanocidal activity. | |
| Autores Ana C.R. Goncalves, et al. | |
| Publicação Molecular Modeling |
Data, Vol/Fasc/Pag Nov 2016 |
| Título Structure and functional dynamics characterization of the ion channel of the human respiratory syncytial virus ... | |
| Autores Gabriela C. Araujo et al. | |