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Química
computacional aplicada
a QSAR
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Pré-requisitos
Recomenda-se conhecimento básico
de linux (Tutorial de Unix), QSAR e de programas de química teórica.
Carga horária
15
horas
Objetivos
Capacitar o aluno na construção
de modelos QSAR (relação quantitativa estrutura
atividade), desde a otimização
de geometria das moléculas e geração de
descritores até a obtenção e
validação
do modelo matemático.
Descrição
O curso será ministrado em 15
horas/aula durante 5 dias. Inicialmente serão apresentados os
conceitos básicos
de QSAR, métodos computacionais de química teórica
e quimiometria aplicada a
QSAR. Em seguida serão apresentados os programas (gratuitos ou
disponíveis no
ambiente CENAPAD-SP) usados para desenho e visualização
de moléculas,
otimização e cálculo de energias,
geração de descritores em QSAR 2D,
construção
e validação de modelos QSAR, dinâmica molecular e
geração de descritores em
QSAR 4D. Durante todo o curso serão propostos exercícios
para que os alunos
coloquem em prática todos os conceitos vistos e sejam capazes de
desenvolver
todas as etapas necessárias para a construção de
um modelo QSAR.
Ementa
1.
Introdução a QSAR
2.
Geração de descritores em QSAR 2D
- Desenho e otimização de geometria
Mecânica
molecular
Mecânica
quântica
- Obtenção de descritores
eletrônicos, topológicos, constitucionais,
geométricos, de lipofilia e solubilidade
3.
Quimiometria aplicada a QSAR
- Construção do modelo
matemático
- Validação cruzada
- Seleção de variáveis
- Processos de validação do modelo
y-randomization
leave-N-out
4.
Geração de descritores em QSAR 4D
- Introdução à metodologia
LQTA-QSAR
- Dinâmica molecular
- Geração de descritores usando o
programa LQTAgrid
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